异位肾的具体症状和肾脏的形态以及结构有关。

有些异位肾和输尿管的结合很顺畅，不会导致尿液排出不畅，患者可以没有任何的症状，有些患者甚至和输尿管结合的部位会出现扭曲，患者可以发生输尿管的绞痛，有些患者在扭曲的基础上会发生输尿管的狭窄，狭窄的部位容易发生泌尿系感染和泌尿系的结石，而且会反复的发作。

如果泌尿系结石阻塞输尿管，就会出现尿道的梗阻，有些患者可以出现一过性的肾功能下降。