造血干细胞移植手术主要有四个步骤：

1.移植前准备。移植选择在患者状态良好的情况下进行，移植前对供者患者进行全身体检，清除感染病灶，存留病房空气消毒等工作。患者在输干细胞之前一周左右进仓，进仓前全身消毒、头发及毛发清除干净，全身药浴等。

2.输干细胞。患者进入存留仓后进行3~5天的治疗，清空骨髓输入供者正常的造血干细胞，回输的时间大约有两天。

3.骨髓抑制期。回输以后患者进入骨髓抑制期，以预防、排斥、感染、输血或者输血小板治疗为主。

4.观察期。患者约20天后，即造血干细胞功能恢复，即可转入普通病房进入一年左右的观察期。