引起虹膜囊肿的原因较多，包括炎症性、寄生虫性、外伤性以及手术导致。其中外伤及手术导致的占多数。这是由于外伤或者手术导致结膜或角膜上皮通过伤口进入前房，种植到虹膜并持续增生。

本病虹膜囊肿手术切除后具有一定的复发几率。术后复发需要再次手术切除，术中切口不宜做得太小。

做大一点可以使囊肿充分暴露，以便清除或抑制残存的囊壁组织，降低其复发的几率。术后注意用眼卫生，清淡饮食，注意休息。