复发性口腔溃疡的诊断可以从病史、好发年龄与性别、口腔专科检查这三方面入手。复发性口腔溃疡具有典型的周期性，反复发作特点，它具有自限性，有局限性，患者有明显的灼痛感，一般消炎药物治疗效果不佳。

在年龄与性别方面，复发性溃疡多见于中青年，而且女性多于男性。轻型阿弗他溃疡口腔专科检查可见唇颊舌的粘膜，数量不多的直径2-4mm的圆形溃疡。疱疹性阿弗他溃疡，散在分布于口腔粘膜各部位，溃疡数目多，可见10-30个不等，分布不成簇。

重型阿弗他溃疡好发于口腔后部，一般为一个较深大的溃疡，愈合后容易有瘢痕或考有组织缺损，而且伴有严重的疼痛。以上三方面常作为复发性口腔溃疡的诊断和鉴别诊断要点。