拉肚子的原因分为炎症感染因素以及非炎症感染因素。

炎症感染因素主要是细菌、病毒、寄生虫、真菌的感染。非炎症感染因素有可能是食物中毒或者是口服药物治疗，尤其是长期口服洋地黄类药物、胆碱能类药物以及泻药时，有可能会导致患者拉肚子症状的反复。

部分患者腹部受凉或者是饮食结构不当时，也可能会导致患者出现拉肚子。部分慢性拉肚子的患者还可能是有肿瘤性疾病或者是小肠吸收不良。在选择用药方面，需要根据疾病的原因合理使用。