类风湿性关节炎肾损害的鉴别诊断，虽然肾脏受累的确切诊断来自于肾活检病理诊断，但患者的临床表现和实验室检查也往往有助于鉴别诊断。例如类风湿性关节炎患者发生肾功能不全主要见于肾脏淀粉样变性和止痛药肾病，一般很少见于膜性肾病和系膜增生性肾小球肾炎。而血尿主要见于系膜增生性肾小球肾炎。

对于无应用金制剂、青霉胺和非甾体类抗炎药的病史，膜性肾病的可能性较小。而继发性淀粉样变性则主要见于长期慢性活动性的类风湿性关节炎患者。