肛门有分泌物主要就是进行局部药物治疗。

首先，可以使用中药成分的制剂进行清洗。比如使用康复新液或者是复方黄柏涂剂进行稀释以后，然后对肛门局部坐浴，也可以使用复方荆芥熏洗剂。在进行坐浴之后还可以适当地涂抹药膏对症治疗。

另外，要针对引起肛门分泌物的原发疾病治疗。比如有痔疮的存在，主要治疗方法就是通过肛管直肠内使用痔疮膏，或痔疮栓对症治疗。

如果是由于肛门周围脓肿、肛瘘等疾病的存在，需要通过手术方法治疗。

如果是由于肛窦发炎、肛管的炎症所引起，可以考虑通过中药的保留灌肠配合药栓，肛管直肠内给药。