指甲有凹横纹可能是指甲外伤所致，比如工作时指甲折断，造成局部损伤，导致该部位营养供给不足，进而出现凹横纹现象。

也可能是由营养不良引起，多见于身体虚弱和吸收不良的患者。也可见于饮食习惯不良导致营养不足的人群，体内容易缺乏营养，导致指甲需要的营养无法得到满足，可能会导致指甲出现凹横纹，指甲光泽也会变差。

此外，也可由某些慢性疾病引起，如肝硬化、肝炎等。这些慢性疾病属于消耗性的疾病，长时间折磨着患者，容易造成体质变差、机体营养不足，也可使患者的指甲产生凹横纹。