宫内暗区和孕囊的区别在于，宫内暗区的情况下，如果通过检测女性的血HCG为阳性，可初步判定为早早孕期间。宫内暗区所出现的时间，要比孕囊出现的时间早。

如果宫内暗区出现，而且出现了停经现象，则提示为宫内妊娠。如果通过B超检查可以看到宫内的孕囊，就可以明确诊断为怀孕。

宫内暗区为孕囊的前身，当宫内暗区生长到一定程度时就会逐渐形成孕囊。但也有一些特殊情况，由于胚胎的质量不佳，可能在宫内暗区阶段就已经停止发育，这种情况可能无法发展成为孕囊。因此，只有通过B超检查看到孕囊，才能确定为怀孕，而且为宫内孕。