尼帕病毒在通常情况下，是会引起患者出现肌肉萎缩的情况发生。导致患者出现肌肉萎缩，是和这种病毒引发出现了不同程度的病毒，引起肌肉代谢功能障碍。尤其是在骨骼肌失代偿、骨骼肌出现结构功能紊乱以后，就会造成肌肉萎缩。

另外，尼帕病毒如果感染人体后可能会造成高热，在高热的情况下还有可能出现红斑肌溶解，所以也会有肌肉萎缩的临床现象。

因此，尼帕病毒感染以后会有可能造成肌肉萎缩，或者周身失代偿代谢失衡等临床现象，需要对这一部分患者进行积极治疗。