目前对于隐睾发生的病因并不十分明确，可能和解剖性因素及内分泌因素有关。

解剖方面可能由于：

1.患者的睾丸引带在蜕变后收缩异常，从而影响睾丸的下降。

2.如果患者的睾丸体积相对较大，超过了内环口、腹股沟管或者外环口的直径，从而影响睾丸下降进入阴囊。

3.胚胎时期因为炎症方面因素，导致睾丸和后腹膜之间的组织粘连，影响睾丸下降。

4.精索血管发育异常，阻碍睾丸下降进入阴囊。

内分泌方面因素是因为患者的垂体下丘脑性腺轴出现异常，导致激素水平比较低，从而导致睾丸下降出现异常。