新生儿休克的原因比较多，大体可以分为低血容量性休克、心源性休克、感染性休克。导致低血容量性休克的原因可以与产时失血或者新生儿期出血，以及细胞外液丢失的水分多有关系。前置胎盘、胎盘早剥，以及胎儿和胎盘之间的输血可以导致产时失血、颅内出血、肺出血。消化道肝脾破裂出血是新生儿期导致出血的比较常见原因。由于呕吐、腹泻或者坏死性小肠结肠炎，以及捂热综合征导致细胞外液丢失引起低血容量。

如果新生儿出现心肌病变或者出现严重的心律失常、心脏的器质性疾病可以出现心源性休克。

如果在宫内或者产时细菌感染，内外毒素释放至血液，也可以导致感染性休克。