鼻中隔脓肿的治疗，主要是以药物治疗和手术治疗两种方式为主。

脓肿程度不严重，可以先通过局部使用抗生素或激素类滴鼻剂类药物，或者是口服头孢、阿莫西林等药物来治疗。抗生素药物的使用，有利于控制鼻中隔脓肿部位的炎症感染，促进脓液的减少。如果脓肿在药物治疗后仍然不能消退，就需要使用手术的方式，来对脓肿的部位进行切开引流，将脓液排出。脓液消退以后，炎症感染也会逐渐消退。

如果有软骨损坏的情况，还需要进行手术的修复治疗，积极的对症处理。