肛门瘙痒有异味可能是患肛瘘。

肛瘘的主要症状是外口流脓，内口处感染产生的脓液经由瘘管由外口流出，急性感染时流出的脓液多带有腥臭味，脓液刺激肛周皮肤引起肛周潮湿和瘙痒。

肛门瘙痒有异味还可能是患肛周湿疹，肛周湿疹的主要症状是肛周瘙痒。发病初期肛门部皮肤潮红，出现散在密集的米粒大小的丘疹，病人感觉奇痒而搔抓。搔抓后皮肤会出现糜烂、破溃、渗出，出现炎症后渗出液会有异味。