精囊炎的治疗主要是以抗生素、抗感染治疗为主。急性精囊炎的治疗主要是用头孢菌素类的抗生素对症治疗。慢性精囊炎的患者通常选用脂溶性较好的，比如大环内酯类以及喹诺酮类的药物进行治疗。

由于精囊炎的发作还和性刺激有很大的关系，所以通常在治疗期间可以使用抗雄激素的药物，比如己烯雌酚来抑制性兴奋，减轻精囊充血和水肿。如果患者有反复出现的血精症状，可以使用5α-还原酶抑制剂，比如非那雄胺来对症治疗。

此外，对于精囊炎的患者，中药也有比较好的效果，还可以服用中药来促进炎症的吸收，已达到彻底治愈的目的。