小孩肚脐眼疼，常见于以下几种原因：

第一，不良的习惯及饮食。如果小孩经常抠肚脐眼或饮食不当，经常吃辛辣、油腻等刺激性食物，可能会出现脐炎，从而出现肚脐眼疼的症状。此时应该在医生的指导下使用碘伏消毒，并且配合抗生素治疗。

第二，肠系膜淋巴结炎，这类疾病可能会导致肠痉挛，而引发上述症状。

第三，阑尾炎。部分阑尾炎的患儿也可能会出现上述情况，此时应该在专业医院进行相关的检查，明确具体的原因后，进行对因处理。