闭经的危害取决于引起闭经的原因，及闭经发生的年龄。

如果是生理性闭经，也就是48~50岁左右发生闭经，这就是正常的，对人体没有危害，也不用进行治疗。如果是生育期女性长期闭经，可能会导致不孕不育。女性闭经后子宫会发生明显萎缩，生理功能会出现障碍，阴道分泌物减少，性生活会疼痛，影响夫妻感情。

另外，若是卵巢早衰引起，40岁之内的女性出现闭经，这样就会提高女性患有高血压、冠心病、糖尿病、骨质疏松的概率，加速女性的衰老，对女性危害较大。