微小度数斜视的病因机制，目前尚不是十分清楚。凡是引起黄斑中心凹抑制暗点，双眼形成异常视网膜对应的原因大多数会形成小角度斜视。目前认为与下列因素有关。

产伤，婴儿在临产时发生视网膜出血，影响了黄斑功能的发育，早期出现黄斑中心凹的抑制性暗点，而在暗点的边缘形成一个固视点，导致斜视。发生年龄比较早又没有被矫正的屈光参差，由于屈光度数较高的眼中心凹未能接受充分的视觉刺激，而产生抑制，形成微斜视。

内斜或外斜手术，因矫正不足或过矫术后残留的小角度斜视。调节性斜视未作处理，随年龄增长残留微斜视。