龟头部位特别发痒的原因跟包皮有关，如果未做好龟头部位的卫生清洗或个体有包茎，造成龟头清洗困难，堆积的包皮垢可引起龟头发痒。

另一原因跟感染因素有关，可见于支原体、滴虫等致病菌感染，常发生于无保护措施的高危性行为后，受到性伴侣生殖道的相关病原体感染。

也可见于致敏原接触导致的过敏性发痒，容易发生于过敏性体质。例如对海鲜、花粉等极为敏感，在生活或工作中如果不慎接触，导致组胺释放即可诱发龟头部位难以耐受的发痒不适感觉。