牙齿根部发黑有可能是蛀牙，在临床医学上导致牙齿根发黑的原因比较多，比如龋齿，会使牙体硬组织出现破坏且颜色发生变化，有的变成黄褐色或者是黑色，可能是其他原因造成的，主要分析如下：

1.与经常吸烟和喝茶、浓咖啡，吃深颜色的食物有关，这类人群牙齿由于外源性着色容易发生变化，造成牙根发黑，主要是色素沉着问题，不是蛀牙。

2.可见于牙周炎，一般在病情严重时容易导致牙槽骨吸收，并致使牙龈萎缩，牙根暴露，长时间下去，由于牙菌斑或结石的附着也会导致牙根发黑。