有的水泡会留下疤痕，而有的水泡则不会留下疤痕，这依据形成的水泡的原因来决定。

当水疱形成是在表皮内部时，没有破坏基底层，一般是不会留下疤痕的。当水泡是在基底层下方的真皮浅层、真皮深层等部位出现时，则有可能会留下疤痕。如果是因为天疱疮而引发的水泡，一般水泡会分布在表皮内的棘层，这时水泡破裂再愈合，并不会对真皮组织造成刺激，所以就不会留下疤痕。

如果是水痘和带状疱疹形成的水泡，也是在表皮内部形成的，也不会留下疤痕。而大疱性类天疱疮或者是疱疹样皮炎形成的水泡，则是在基底层下方，这时就会对基底膜的结构形成破坏，再次消失之后就会留下疤痕。