确诊日本血吸虫病有三个方面的方法：

第一，是要进行血液方面的检查，可以进行血液和粪便的涂片，通过涂片可以发现血吸虫。发生脑部血吸虫感染的患者，可以进行脑脊液的检查，还可以进行尾蚴膜实验。

第二，是影像学的检查，可以对患者进行B超、CT等相关检查，明确患者肝脏、头部病变的部位，协助诊断血吸虫病。

第三，对于部分患者还可以进行肠镜的检查，可以更加直观的观察肠道的病变，对患者的病史进行追踪是诊断的前提条件。