目前对于引发甲状舌管囊肿的病因尚不明确，通常认为与遗传因素、局部感染、外伤、接受放疗治疗等因素有关。而鳃裂囊肿主要是由于在胚胎发育期间，鳃裂没有完全消失导致上皮组织发生残留而引起。

甲状舌管囊肿会在颈部中线的附近出现无压痛性肿块，肿块会随着进食或者伸舌头发生活动。而鳃裂囊肿会在面颈部的两侧出现肿块，通常也没有疼痛感。

但是甲状舌管囊肿与鳃裂囊肿都容易引发感染，因此一旦确诊后，需要及早的进行手术治疗，以此来减少对患者的损害。