甲状腺胶质囊肿一般不会自愈。

在甲状腺胶质囊肿早期一般不会有什么症状，只需要控制饮食，减少碘的摄入，密切观察病情发展情况就可以。如果甲状腺胶质囊肿比较大，并且伴随着明显肿块，使病人出现呼吸困难等症状，就需要采取手术切除的方法将囊肿摘除，以缓解气管的压迫。

甲状腺胶质囊肿在不治疗的情况下不会自动消失，而且囊肿会随着时间的延长而不断增长。同时也要注意囊肿会出现恶变的情况，虽然临床上囊肿出现恶变的几率非常低，但是不积极配合治疗，也有可能会发生恶变。