大便臭与便秘、饮食因素、肝、胆、胰腺疾病有关。

植物神经功能紊乱、胃肠道蠕动缓慢，导致食物残渣长期在肠道内滞留，水分被反复吸收，导致大便干结。大便在肠道内停留的时间过长，细菌分解时产生特殊的臭味，解出的大便会比较臭。另外，经常进食高蛋白质、高脂肪、高糖、高油脂类的食物，细菌分解时产生过多的胺性物质，导致大便产生明显的臭味。

除此以外，肝、胆、胰腺方面的疾病，导致消化液功能不足，食物摄入后不容易被消化、吸收，在细菌的作用下产生吲哚，导致大便发臭。肠道有炎症、肿瘤，导致食物不能完全消化，大便也会比较臭。