一部分靶向药物可以用作术后预防的，而这里所谓的术后预防，指的是术后的辅助治疗。

比如乳腺癌病人进行了根治性手术切除之后，如果病理的免疫组化或者荧光原位杂交确认了HER2基因扩增，就可以在手术之后使用抗HER2基因的靶向药物进行术后的辅助治疗。而在这些靶向药物应用的同时，往往还需要进行化疗。通过化疗和靶向药物的联合使用，达到延缓病人的术后复发，延长病人的生存期的目的。

还有一部分非小细胞肺腺癌的病人，如果在手术之后确认了病人的EGFRG存在敏感突变，并且病人是三期肺癌，就可以在手术之后应用针对HER2基因的靶向药物进行术后的辅助治疗。