治疗排卵障碍的药物有促排卵药，如克罗米芬，来曲唑等口服剂型的，还有一些肌注剂型的，如天然促性腺激素，包括尿促性素、尿源性人卵泡刺激素。

还有基因重组促性腺激素，有绒毛膜促性腺激素，促性腺激素释放激素激动剂，还有促性腺激素释放激素拮抗剂等。另外还有一些辅助药物，如溴隐亭、二甲双胍等药物。这些药物协同作用，可以促进卵巢排卵，治疗因为排卵障碍引起的不孕症。