新生儿呼吸窘迫综合征会产生后遗症，比较常见的后遗症有气胸、氧中毒。恢复期动脉导管开放，可能会导致患者出现间歇性呼吸暂停、心力衰竭、胸痛、呼吸困难加重。也可能会导致患者出现体温不稳定，表现为体温过低不升高。

如果患者同时有并发肺部感染等疾病时，除了出现呼吸困难以外，还可能会出现喂养困难、反应差、昏迷等呼吸循环衰竭症状。

如果病情较为严重并且没有及时地治疗时，可能会在72小时内死亡。因此，明确疾病诊断后，需要给予立即用药治疗。