掌指骨结核早期的症状主要表现为手掌的手指出现肿胀和疼痛，同时还会伴有局部压痛感，随着病情进一步加重，会形成脓肿。

当脓液流入到患者的软组织内，就会引发寒性脓肿，致使窦道形成。这时如果骨骼病灶侵入患者的皮下组织，会使患者出现皮肤暗红色，局部也会出现明显的肿胀，疼痛症状也会随之明显。

患者也会逐渐表现出现全身性的症状，比如低热、盗汗、浑身乏力、食欲减退、身体消瘦等。少数儿童患者往往会呈现出急性发病症状，主要表现为高热。