儿童患有松果体瘤的良性症状有头痛。松果体瘤增大后会对局部造成压迫，还可以导致颅内压不同程度的升高，所以患者头痛的症状最常见。如果头痛的症状比较剧烈，患者还可以伴有恶心、呕吐的症状。

儿童发生松果体瘤后还会影响体内促性腺激素的分泌，可以使促性腺激素的分泌增多，患儿可以表现为性早熟的症状。

性早熟主要以男性患者为主，患儿可以表现为巨大的生殖器，有些患儿发生松果体瘤后还可以对颅神经造成压迫。