发烧后耳朵疼是否能自行痊愈，和患者的具体情况有关。

多数患者发烧可能是感冒引起的，比如感冒引起上呼吸道炎症，可能导致耳朵疼痛。如果耳朵疼痛症状较轻，等发烧和上呼吸道感染症状逐渐恢复后，耳朵疼痛的情况能自行好转。

如果发烧引起了急性中耳炎，耳朵疼痛的程度比较剧烈，很难自行恢复。需要结合医生的意见，采取抗感染的治疗措施，必要时给予止痛药物能缓解疼痛。

如果出现耳道内流脓、流水、流血、听力下降等症状，还要及时到医院耳鼻喉科就诊，避免症状进一步加重。