女生3个月没来月经的原因有很多，首先要排除怀孕，因为怀孕之后是不会来月经，只要有性生活，就要通过尿妊娠试验或者B超检查排除怀孕。

如果只是初潮不久的女生，3个月没来月经，身体没有过度肥胖，大多数是正常的，因为初潮短时间内卵巢的功能还不完善，很多确实会发生月经不调、月经周期不规律。

如果初潮后2年以上的女生3个月没来月经，就确实是存在月经不调，有可能是多囊卵巢综合征、高泌乳素血症，也有些可能存在甲状腺功能异常，或者是近期学习工作压力过大，以及生活环境的改变、饮食习惯的改变，都有可能导致3个月不来月经。

所以一定要根据具体的情况才能进行判断，通过询问病史，结合一些相关检查，才能够进一步明确。