如果女性检查彩超，发现有三厘米的卵巢囊肿，通常都不需要进行手术，无论是普通的卵巢囊肿，还是卵巢巧克力囊肿，或者是炎症刺激引起的卵巢囊肿。

只是对于不同的囊肿性质，其处理治疗的方法可能会有一定差异而已，比如女性是出现卵巢巧克力囊肿，常常可能需要考虑口服米非司酮片，或者是肌注亮丙瑞林，来抑制巧克力囊肿的继续长大，而且还可以考虑尽快备孕、怀孕，因为在怀孕以后囊肿就会萎缩变小。

如果是普通的卵巢囊肿，可能不需要做特殊处理。