少女月经不来大都是由于女性体内的生殖器官发育异常所导致的，其中包含有处女膜闭锁又称之为无孔处女膜。由于在发育的过程中处女膜没有孔，从而导致阴道分泌物和月经血无法流出，聚集在阴道内。

另外，有的女性是由于阴道发育异常所导致的。临床上有一种先天性无阴道患者，这样的患者她的卵巢是正常的，所以往往表现出少女的体征，但是由于没有阴道，也没有子宫，所以也不会有月经来潮。

还有的女性是由于阴道下段闭锁，导致了女性的月经血无法排出而引起的。