釉质发育不全的原因是牙齿结构发育异常的一种疾病，釉质发育不全可以分为遗传性和环境因素导致的釉质发育不全，其病因有局部性、遗传性及全身性因素，如先天性梅毒、营养不良、传染病等。

牙釉质发育不全是牙釉质形成量减少，而不是矿化质量减低，比如孕妇在怀孕的时候，有全身性疾病患风疹病、毒血症等，婴儿期患高热性疾病，如肺炎、麻疹等均可导致发生以及营养不良、维生素D及钙缺乏以及免疫遗传因素，也可以导致发育不全，乳牙的根尖周感染，也会造成牙釉质发育不全。