小儿秋季腹泻常见的病原体是轮状病毒。

轮状病毒感染引起的腹泻主要发生在秋冬季节，是婴幼儿时期比较常见的感染性腹泻。因为发生在秋冬季节，又称为秋季腹泻。轮状病毒是呼肠科中的一个属，轮状病毒主要有七个组，引起人类感染的主要是A组、B组和C组。

A组轮状病毒可以引起全世界各地的婴幼儿发生腹泻，主要在秋冬季节。B组的轮状病毒还曾经引起成人的腹泻大流行。而C组的轮状病毒会导致散发性的腹泻。所以，小儿常见的秋季腹泻的病原体是轮状病毒。