梅克尔憩室形成的原因，主要是在人体胚胎发育的过程之中，大约第6~8周左右，卵黄管开始纤维化，并且慢慢闭锁，然后逐步萎缩成一个连接肚脐和中肠的纤维索带。

但是有部分的胎儿，在卵黄管退化的过程中，会发生异常，卵黄管靠近肚脐的那一端，已经完全吸收并且退化，但是靠近肠道端，却有时候没有完全闭合，有部分的残留。这一部分未退化的卵黄管，就叫做梅克尔憩室。

此病一般刚开始没有明显的症状，只有发生憩室炎、肠套叠、肠梗阻的时候，才会有明显的症状。