宫颈那氏囊肿绝大多数情况下是子宫颈的生理性变化。子宫颈转化区内鳞状上皮取代柱状上皮的过程中，新生的鳞状上皮覆盖子宫颈腺管口或深入腺管，将腺管口阻塞导致腺体分泌物引流受阻潴留形成囊肿。有一种情况是子宫颈的局部损伤或子宫颈的慢性炎症，使腺管口狭窄。也可以导致子宫颈腺囊肿形成。检查时可以看到宫颈表面有单个或多个青白色的小囊泡，容易诊断。宫颈纳氏囊肿通常不需要处理。深部的宫颈纳氏囊肿，表现为宫颈肥大，也无需特殊治疗。