正常情况下头颅CT是不会引起疼痛的。头部CT扫描虽然是X光扫描，但是一次常规的头部CT检查是不会引起头部疼痛的。

如果患者检查后出现头疼问题，要考虑是不是患者自身因素所致，比如是不是检查前一晚有熬夜的情况，平时有没有失眠、焦虑的问题，是否有幽闭恐惧症。这些都有可能导致头部不适、头疼的问题，但是这些和CT检查没有直接关系。

另外，如果做的是增强检查，造影剂有可能会引起轻微的头部不适，这种一过性的，患者过一段时间休息就好了。