大多数的肛周脓肿，是由于肛隐窝感染化脓，脓液扩散到肛门周围软组织间隙内而形成的，偶尔也可以由于肛门外伤感染导致。

肛周脓肿是肛周软组织的急性化脓性炎症疾病，根据发病组织间隙深浅的不同，可以分为深部肛周脓肿，以及浅部肛周脓肿。浅部肛周脓肿的查体，可以在肛门周围软组织上见到红肿隆起的包块，压痛、胀痛明显，有的可触及波动感。如果不及时治疗，脓肿会自行破溃，逐渐形成慢性炎症，引起肛瘘，可以择期手术治疗。

深部的肛周脓肿肛门表面无异常，触诊可发现患处质韧水肿。患者常有肛门坠胀不适，以及发热等症状，需要及时手术治疗，否则有可能会引起败血症，或者脓毒血症。