乳腺囊肿在临床的医学上不存在自愈，有增大的可能，因为乳腺囊肿是由于乳腺发育过程，或者是退化中出现失常从而引发的症状，但这种病还达不到疾病的范畴。

囊肿的大小也关系到乳腺囊肿是否能够自愈，当乳腺囊肿小于1cm，可以随着时间的推移慢慢减小、消失，达到自愈；乳腺囊肿的体积较大时一般无法自行消失。

如果单纯只有囊肿，能够用抽吸术将囊内液体抽取出来，经过多次的抽吸，可使囊肿逐渐变小；某些多发性的积乳囊肿也能够用抽吸术来进行治疗，达到治愈的效果。