长期甲减如果没有得到有效的治疗，会引起严重的并发症，像甲减性心脏病，是甲状腺功能未得到有效的控制而导致心肌的改变或者心包积液，或者两者并存。

患者心脏扩大、心搏出量减少，临床上可表现为心率减慢、心音低钝、心脏扩大。长期甲减未得到有效治疗，还会引起浆膜腔积液，以心包积液或严重腹水为主要表现，会使患者胸闷、气逼、心衰、腹胀。

另外，一些长期未得治疗的甲减患者，会引起垂体肥大的影像学特征。