导致男性出现射精疼痛及精液中有血的具体病因，需要结合患者疼痛的位置、有无其他伴随症状，以及相关检查结果综合分析。

如果射精时出现会阴部疼痛无其他伴随症状，但尿常规及泌尿系彩超等检查无明显异常，则考虑为精囊炎所引起。应进一步完善精液常规及细菌培养检查，根据检查结果选择敏感抗生素积极抗炎治疗，必要时定期排精辅助治疗。

如果射精时出现尿道疼痛，且伴有尿频、尿急、尿痛等症状，则考虑为尿道炎症所引起。发生尿道炎症时尿道黏膜有炎性损伤，精液经尿道排出时刺激尿道黏膜导致疼痛。此时应予以抗炎治疗，并增加饮水量多排尿，以便于将尿道内的部分细菌排出，辅助抗炎治疗。