导致阴囊瘙痒、疼痛的原因不同，治疗方式也不一样。如果阴囊瘙痒、疼痛为真菌感染所引起，在确诊以后，应当外用氟康唑软膏进行治疗，能够抑制真菌繁殖，并且消除真菌。在严重时还可配合口服抗真菌的药物治疗，比如伊曲康唑。

如果阴囊瘙痒、疼痛为过敏因素所引起，应当先避免接触过敏原，使用抗过敏的药物进行治疗，比如氯雷他定。当症状特别严重时，还可少量食用糖皮质软膏改善不适症状。

在治疗的过程当中，也要注意下体卫生，避免穿过紧的内裤，多休息，清淡饮食。