感染贝塔毒株有可能会引起头疼。

因为贝塔毒株的毒性相对较强，传染性较强，机体一旦感染贝塔毒株会表现出明显的呼吸系统不适症状，例如咳嗽、咳痰、咽喉肿痛以及不同程度的呼吸困难等，伴有持续不退的体温升高，病情逐渐发展会导致大脑神经中枢的功能异常，患者可能会表现出头晕、头痛等不适症状。而且病情发展比较迅速，需要尽早给予对症治疗。

因此，患者一旦被确诊为贝塔毒株感染，需要立即给予紧急隔离治疗，以抗病毒、降体温、维持正常的生理功能为主，尽快改善不适症状。