血管免疫母细胞性淋巴结病的发生，主要是由于T淋巴细胞调控失常，B淋巴细胞经抗原启动后，可以发生过度的增殖，病毒感染有可能是原因之一。有报道，血管免疫母细胞性淋巴结病的患者，体内有可能能够找到风疹病毒抗原。

另外，还和一些药物过敏因素有关系，常见的有可能能够诱发血管免疫母细胞性淋巴结病的药物，包括青霉素类的药物、抗惊厥药、解热镇痛药、磺胺类、抗癫痫药等。

另外，一些胶原性疾病，有可能会导致血管免疫母细胞性淋巴结病的发生，比如系统性红斑狼疮、类风湿性关节炎以及干燥综合征等。具体的发病原因，目前并不是特别明确，还处于研究当中。