输精管囊肿可以吃具有活血、消肿、抗炎功效的中药或者中成药治疗，常见的中药有桃仁、蒲黄、三七、丹参、蜈蚣、杜仲等。另外，还需要搭配具有抗炎作用的西药治疗，例如常见的药物有左氧氟沙星胶囊、替硝唑胶囊等。

输精管囊肿服药需要按疗程服用，不能自行停止用药，否则会影响囊肿正常吸收。通常服药一个月左右，建议做输精管彩超检查，明确囊肿是否有所消肿。

如果囊肿吸收不明显，则建议通过手术的方法治疗。