寻常疣的危害一般会导致皮肤或者黏膜部位的损伤，会在皮肤和黏膜上方形成一些角化性的丘疹。这些丘疹表面粗糙，有的时候呈单个分布，有的时候可以密集排列，伴随着按压性疼痛。

如果生长到指甲下方，会引起指甲损毁。如果生长得比较大，加上外界的摩擦、刺激，会引发局部皮肤出现强烈的瘙痒。个别人群的寻常疣因瘙痒而经常搔抓，会引起局部出血，从而形成表皮感染细菌，引发糜烂、渗出。

如果寻常疣侵犯到眼角膜，还会引发角膜炎，对人体的视力有可能会造成影响，所以要尽快将这种疾病治疗好。