引起口咽癌患者在患病过程中出现头疼的主要原因包括以下三点：

第一，由于疾病情况较为严重的患者，其体内癌细胞对患者头部神经组织进行扩散转移，从而引发患者出现不同程度的头疼现象，这是目前引起口咽癌患者出现头疼的主要原因。

第二，也有可能是由于患者体内癌细胞对患者口腔部位神经发生侵袭，从而引起患者出现剧烈的口腔部位神经疼痛，进而引发患者出现相关头痛症状。

第三，已经出现扩散转移现象的患者，需要进行不同阶段的放化疗来抑制体内癌细胞的扩散，也有可能是由于化疗药物对患者产生的副作用而引起患者出现头疼症状。