当头皮毛囊炎导致脱发时要积极地进行治疗，如果治疗不及时可能会导致永久性脱发。

对于比较轻微的毛囊炎，可以使用二硫化硒洗剂来清洗头皮，可以有效地去油并且控制真菌。若头皮毛囊炎呈现红色的小疙瘩并且伴有脓疱，大多数属于细菌毛囊炎，可以使用碘伏或者酒精进行消毒，然后外涂百多邦软膏或者夫西地酸乳膏等。若头皮毛囊炎反复地发作，并且数量又比较多，患者可以在外用药物的基础上搭配一定的口服药，例如多西环素等。

同时对于头皮毛囊炎而导致脱发的患者，平时要注重头部皮肤的清洁，避免头发油腻。